Jumlah populasi beruang madu menurun sebanyak lebih kurang 30% dalam tempoh 30 tahun menyebabkan mereka diklasifikasikan sebagai ‘terdedah’ pada tahun 2007, bermakna mereka berada dalam risiko kepupusan dalam habitat liar (IUCN, 2007). Beruang madu menghadapi tiga (3) ancaman utama:
Kehilangan Habitat - Seperti spesis-spesis yang lain, penebangan hutan dan kerosakan habitat telah mengurangkan jumlah mereka secara dramatik. Punca utama di Borneo adalah pembangunan ladang, pembalakan secara haram atau secara tidak lestari dan juga kebakaran yang berpunca daripada manusia. Di Sumatra dan Borneo, penukaran hutan kepada ladang sawit atau tanaman-tanaman lain berlaku secara berskala besar pada kadar 1,000 km persegi setiap tahun (Holmes, 2002).
Pemburuan Komersil dan Haram - Kebiasaannya, beruang madu diburu untuk hempedu mereka (untuk diguna dalam perubatan tradisional Cina) dan tapak kaki mereka (untuk makanan mewah). Di China dan Vietnam, hempedu beruang ‘diperah’ daripada beruang tersebut ketika mereka masih lagi bernyawa. Kebiasaannya, beruang-beruang ini akan ‘digantikan’ dengan beruang madu dari populasi liar kerana mereka tidak akan hidup lama di dalam ‘ladang’ tersebut. Membunuh beruang madu adalah diharamkan dalam kesemua negara yang mempunyai populasi mereka, namun perkara ini secara amnya adalah tidak terkawal dengan baik.
Pemerdagangan Haiwan Peliharaan - Beruang madu merupakan beruang terkecil di dunia. Oleh itu, anda boleh bayangkan betapa comelnya anak beruang madu; ini menjadikan mereka antara sasaran penggemar haiwan peliharaan eksotik dan mempunyai nilai jualan tinggi dalam pasaran gelap. Sang ibu akan dibunuh untuk mendapatkan anak beruang madu dan kebiasaannya mereka akan disimpan di dalam kandang kecil dengan keadaan yang tidak terjaga.